RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM63AO94886 807 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 NXPH2O95156 264 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 CLDN1O95832 211 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 CHRNA7P36544 502 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 E2F5Q15329 346 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 C2CD6Q53TS8 623 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF774Q6NX45 483 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PIGZQ86VD9 579 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 DYRK2Q92630 601 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ERAP1Q9NZ08 941 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 KLK13Q9UKR3 277 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.53□□□□□ -1.84
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.53□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 KPNA7A9QM74 516 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 E9PI62 339 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 TPPPO94811 219 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 MS4A2Q01362 244 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 RIGQ13278 110 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 RAPSNQ13702 412 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 HLA-BQ31612 363 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 WLSQ5T9L3 541 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 JADE1Q6IE81 842 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 KLHL35Q6PF15 583 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 TMTC3Q6ZXV5 915 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 PXKQ7Z7A4 578 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CDC20BQ86Y33 519 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 NIPA2Q8N8Q9 360 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 OMA1Q96E52 524 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 TAS2R14Q9NYV8 317 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 AMACRQ9UHK6 382 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.52□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 A8MZ25 164 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 NPHP1O15259 732 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 RARGP13631 454 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 UGT1A4P22310 534 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CA4P22748 312 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CX3CL1P78423 397 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 DRP2Q13474 957 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 KRT33BQ14525 404 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 ERC1Q8IUD2 1116 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 LACC1Q8IV20 430 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CMTM3Q96MX0 182 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 USP28Q96RU2 1077 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC61Q9BV99 259 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 MUC13Q9H3R2 512 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.51□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 GPIP06744 558 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CA6P23280 308 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 PON1P27169 355 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 ARL3P36405 182 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 HNF4AP41235 474 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 PDX1P52945 283 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 GSDMDP57764 484 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 DMPKQ09013 629 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 NECTIN1Q15223 517 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 LINGO4Q6UY18 593 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.5□□□□□ -1.85
UBE2B-202ENST00000499038 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms