RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 C21orf59P57076 290 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PFN3P60673 137 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ID3Q02535 119 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 KLC3Q6P597 504 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CNSTQ6PJW8 725 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 DET1Q7L5Y6 550 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM74Q86UV6 250 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PARGQ86W56 976 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 DCLK2Q8N568 766 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SLC6A18Q96N87 628 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 NDNQ99608 321 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SH3GL2Q99962 352 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 BOCQ9BWV1 1114 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OR2AG1Q9H205 316 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SNX15Q9NRS6 342 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 EURLQ9NYK6 297 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 RAB23Q9ULC3 237 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GPR34Q9UPC5 381 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 VWA7Q9Y334 891 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0C4DFX4 3053 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OR2AG2A6NM03 316 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf172C9J069 976 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 KMOO15229 486 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 NUAK1O60285 661 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 KCNJ13O60928 360 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC6O75061 913 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GLRA3O75311 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MTX2O75431 263 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 FAM155BO75949 473 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SP9P0CG40 484 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 THEGLP0DJG4 465 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CBSLP0DN79 551 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 GABRB3P28472 473 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CD38P28907 300 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CBSP35520 551 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SLC26A3P40879 764 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ABCG1P45844 678 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CLDN2P57739 230 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 B4GALNT1Q00973 533 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 LRP8Q14114 963 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 INSCQ1MX18 579 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TRABD2AQ86V40 505 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OXR1Q8N573 874 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB2Q8N680 514 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 HM13Q8TCT9 377 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 NELL1Q92832 810 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM159Q96B96 161 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 APOPT1Q96IL0 206 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 BIRC8Q96P09 236 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MKS1Q9NXB0 559 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 MID2Q9UJV3 735 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 INVSQ9Y283 1065 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-211ENST00000497210 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms