RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492778.5

CRAMP1-207, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 573 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1-207ENST00000492778 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RNF14Q9UBS8 474 aa8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CROTQ9UKG9 612 aa8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 BSNQ9UPA5 3926 aa8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.64□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CDC14CA4D256 554 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 OR5K3A6NET4 321 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SGTAO43765 313 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 AP2A1O95782 977 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 DLGAP3O95886 979 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ITGB2P05107 769 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 TCN2P20062 427 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CDH3P22223 829 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ACRV1P26436 265 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CCR10P46092 362 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PRLHRP49683 370 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 POLE2P56282 527 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 VSNL1P62760 191 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PRKAA1Q13131 559 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RPS6KA1Q15418 735 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 GPR19Q15760 415 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 DBN1Q16643 649 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 P3H1Q32P28 736 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 BCL7AQ4VC05 210 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 KCTD11Q693B1 232 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 WDR93Q6P2C0 686 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 XKR5Q6UX68 686 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ESX1Q8N693 406 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CCDC89Q8N998 374 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 HM13Q8TCT9 377 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 LCN9Q8WX39 176 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PBKQ96KB5 322 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RUFY1Q96T51 708 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ZPBPQ9BS86 351 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 HGH1Q9BTY7 390 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SPRY4Q9C004 299 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 COG4Q9H9E3 785 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PDE7BQ9NP56 450 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RARRES3Q9UL19 164 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.63□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PIPSLA2A3N6 862 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 LIASO43766 372 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 OR1I1O60431 355 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 GAS8O95995 478 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 PVRP15151 417 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 STAT5AP42229 794 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CACNG1Q06432 222 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ABHD18Q0P651 414 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CDC20Q12834 499 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 KCNAB2Q13303 367 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 CT55Q8WUE5 264 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 ELMO1Q92556 727 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 HDAC10Q969S8 669 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.62□□□□□ -1.03
CRAMP1-207ENST00000492778 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms