RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478271.1

EXOSC10-208, Transcript of exosome component 10, human

TSL 2

Gene EXOSC10, Length 608 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOSC10-208	ENST00000478271	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CFHR1	Q03591	330 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	NR1D2	Q14995	579 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TMED2	Q15363	201 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CCDC157	Q569K6	752 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	KLC3	Q6P597	504 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	VRK3	Q8IV63	474 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZIM3	Q96PE6	472 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PANX3	Q96QZ0	392 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	NRTN	Q99748	197 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	COG4	Q9H9E3	785 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CDYL	Q9Y232	598 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	MED16	Q9Y2X0	877 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	RP1	P56715	2156 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM159B	A6NKW6	160 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	NIPSNAP2	O75323	286 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TCEA3	O75764	348 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PIAS1	O75925	651 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	AHSG	P02765	367 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FTH1	P02794	183 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ESR1	P03372	595 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	MPO	P05164	745 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	GP1BA	P07359	652 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PNLIP	P16233	465 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	STMN1	P16949	149 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CRABP2	P29373	138 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FMO4	P31512	558 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PREP	P48147	710 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CCT5	P48643	541 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	RGS4	P49798	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	SERPINB8	P50452	374 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	PDX1	P52945	283 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	OR1D5	P58170	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	POU4F1	Q01851	419 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FOXC1	Q12948	553 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	ILK	Q13418	452 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	RPE65	Q16518	533 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	SYTL3	Q4VX76	610 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	MROH9	Q5TGP6	573 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CNST	Q6PJW8	725 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	SPRED1	Q7Z699	444 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	TDRP	Q86YL5	185 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	CCDC63	Q8NA47	563 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	HM13	Q8TCT9	377 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	MAPK15	Q8TD08	544 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		6.53	□□□□□ -1.36
EXOSC10-208	ENST00000478271	GLMN	Q92990	594 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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