RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	MIOS	Q9NXC5	875 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PRQ8	180 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CAPN9	O14815	690 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	FGF17	O60258	216 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	DIAPH2	O60879	1101 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	HSPA4L	O95757	839 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CRYAA	P02489	173 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	TFAP2A	P05549	437 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	KRT19	P08727	400 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	DANCR	P0C864	163 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	MTHFR	P42898	656 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	SLC9A3	P48764	834 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CAMK2D	Q13557	499 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PACS1	Q6VY07	963 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PTOV1	Q86YD1	416 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA17	Q96L03	361 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	SEPHS2	Q99611	448 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	MMP28	Q9H239	520 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	DPP3	Q9NY33	737 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	3.91	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454		A0A0G2JNG1	304 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	XPNPEP2	O43895	674 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TOMM70	O94826	608 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	GCNT3	O95395	438 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	OR2T7	P0C7T2	308 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SCG2	P13521	617 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CSF2RA	P15509	400 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ANOS1	P23352	680 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PSMC4	P43686	418 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PHEX	P78562	749 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	RBPJ	Q06330	500 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TFCP2	Q12800	502 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KIR2DS5	Q14953	304 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	STPG1	Q5TH74	334 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KRT39	Q6A163	491 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454		Q6ZTC4	211 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454		Q8NFD4	153 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	KIF18A	Q8NI77	898 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	NODAL	Q96S42	347 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ABHD6	Q9BV23	337 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	NOTCH4	Q99466	2003 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CLK1-208	ENST00000464454	CTAGE9	A4FU28	777 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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