RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 TCAF1Q9Y4C2 921 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 AP3B1O00203 1094 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 MATN2O00339 956 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TERTO14746 1132 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CEP104O60308 925 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 FTH1P02794 183 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 SFTPCP11686 197 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ITGB6P18564 788 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ACADLP28330 430 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CXCR5P32302 372 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 KCNJ1P48048 391 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 NPY2RP49146 381 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ARMC6Q6NXE6 501 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 AFTPHQ6ULP2 937 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 RASGRP3Q8IV61 690 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 REXO1L1PQ8IX06 675 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 UNC5BQ8IZJ1 945 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PRELID2Q8N945 189 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PHC3Q8NDX5 983 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 LCN9Q8WX39 176 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 41.2
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CATSPER2Q96P56 530 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 SRMSQ9H3Y6 488 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CHRAC1Q9NRG0 131 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 C1GALT1Q9NS00 363 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 IL17BQ9UHF5 180 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 POMT2Q9UKY4 750 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 RARRES3Q9UL19 164 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 BTRCQ9Y297 605 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 B8ZZF3 427 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 BTN3A3O00478 584 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 NKX2-8O15522 239 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 OR1I1O60431 355 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA0754O94854 1291 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 RECKO95980 971 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 MT-ND3P03897 115 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 OR56A5P0C7T3 313 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 MSL3P1P0C860 447 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 F8A1P23610 371 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PREPP48147 710 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CDK16Q00536 496 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PRKAA1Q13131 559 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TUBB3Q13509 450 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 KCNAB1Q14722 419 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 GSTA5Q7RTV2 222 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF605Q86T29 641 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 AMIGO1Q86WK6 493 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 RASGEF1CQ8N431 466 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ELMO2Q96JJ3 720 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CARD6Q9BX69 1037 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 FGF21Q9NSA1 209 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TREX1Q9NSU2 369 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 PADI1Q9ULC6 663 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 JRKLQ9Y4A0 524 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 F8W8V4 182 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 DYNC1I1O14576 645 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 KIF5CO60282 957 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TIAF1O95411 115 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 EBLN1P0CF75 366 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TPSB2P20231 275 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 MAGEA6P43360 314 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 ARL4DP49703 201 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TUBB4BP68371 445 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 PRAMEP78395 509 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 MC1RQ01726 317 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TUBB2AQ13885 445 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 SEMA3AQ14563 771 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TPSAB1Q15661 275 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TMTC4Q5T4D3 741 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 LRRC8BQ6P9F7 803 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 BORAQ6PGQ7 559 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 TBC1D21Q8IYX1 336 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 OR8K5Q8NH50 307 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-210ENST00000462125 ELMO1Q92556 727 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms