RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL35Q6PF15 583 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 VRK3Q8IV63 474 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 IL22RA1Q8N6P7 574 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 ACVR1CQ8NER5 493 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 LCN9Q8WX39 176 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 KIFC1Q9BW19 673 aa23.25■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARMC6Q6NXE6 501 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 CASC4Q6P4E1 433 aa23.24■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL25Q9H0H3 589 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 MVB12BQ9H7P6 319 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 ASF1AQ9Y294 204 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 TLCD2A6NGC4 264 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 TPBGLP0DKB5 382 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC41A2Q96JW4 573 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 ULBP3Q9BZM4 244 aa23.22■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFS3O75489 264 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0754O94854 1291 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 DLGAP3O95886 979 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARL4DP49703 201 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 GSTM4Q03013 218 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR19Q15760 415 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC39A7Q92504 469 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 P2RY12Q9H244 342 aa23.21■■□□□ 1.31
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SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-208ENST00000459627 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 SPAG6O75602 509 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PVRP15151 417 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 CDH3P22223 829 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 FMO4P31512 558 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 FNTAP49354 379 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 TTPAP49638 278 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ABRQ12979 859 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PRKAA1Q13131 559 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 TUBB3Q13509 450 aa23.2■■□□□ 1.3
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