RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 FERD3LQ96RJ6 166 aa25.59■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 MFRPQ9BY79 579 aa25.59■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 LUZP4Q9P127 313 aa25.59■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 PADI2Q9Y2J8 665 aa25.59■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 A6NL46 340 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 CFAP99D6REC4 459 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 CBFA2T2O43439 604 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 HBQ1P09105 142 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 RNF224P0DH78 156 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 ST6GAL1P15907 406 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 RANBP10Q6VN20 620 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 RCOR2Q8IZ40 523 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 SGSM3Q96HU1 749 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 COPS8Q99627 209 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf43Q9BQ61 176 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 GORASP1Q9BQQ3 440 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.58■■□□□ 1.69
PBRM1-218ENST00000458294 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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PBRM1-218ENST00000458294 C5AR2Q9P296 337 aa25.58■■□□□ 1.69
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PBRM1-218ENST00000458294 SPTBP11277 2137 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 C9J4A7 227 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 E7EQ34 232 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 BTN3A3O00478 584 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 BTN3A1O00481 513 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 MFAP3LO75121 409 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 CRTAMO95727 393 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 AGXTP21549 392 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 LMAN1P49257 510 aa25.57■■□□□ 1.68
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PBRM1-218ENST00000458294 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 PTCHD3Q3KNS1 767 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 NXPE1Q8N323 547 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 COG4Q9H9E3 785 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 MAP10Q9P2G4 905 aa25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC66A2RUB6 948 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ITGALP20701 1170 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 RBL1P28749 1068 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ADRA1AP35348 466 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 HADHAP40939 763 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 CD151P48509 253 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ATP1A4Q13733 1029 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 SARM1Q6SZW1 724 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 BBS12Q6ZW61 710 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 SNX20Q7Z614 316 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 IP6K3Q96PC2 410 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 C17orf62Q9BQA9 187 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 FERMT1Q9BQL6 677 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 OR52A5Q9H2C5 316 aa25.56■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 MVB12BQ9H7P6 319 aa25.56■■□□□ 1.68
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PBRM1-218ENST00000458294 C2orf74A8MZ97 194 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 APOC2P02655 101 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 AMIGO1Q86WK6 493 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 OR52E1Q8NGJ3 308 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 PRR7Q8TB68 274 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 VPS37BQ9H9H4 285 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 PCSK5Q92824 1860 aa25.55■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 NOTCH2Q04721 2471 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 A1L4Q6 167 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 H7C0C1 242 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF749O43361 778 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ATP5OP48047 213 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF449Q6P9G9 518 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 GPR135Q8IZ08 494 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 APOL2Q9BQE5 337 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 RPA4Q13156 261 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 PRPSAP1Q14558 356 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 GPR33Q49SQ1 333 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 VSTM4Q8IW00 320 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 IQCKQ8N0W5 287 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 FAM96AQ9H5X1 160 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 ACTR10Q9NZ32 417 aa25.53■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 IGHEP01854 428 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 PVRP15151 417 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 OTX2P32243 289 aa25.52■■□□□ 1.68
PBRM1-218ENST00000458294 MARCKSL1P49006 195 aa25.52■■□□□ 1.68
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