RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPN4P29074 926 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MC4RP32245 332 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTGIRP43119 386 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABRA4P48169 554 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLLT10P55197 1068 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBB4BP68371 445 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSD11B2P80365 405 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBB2AQ13885 445 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL35Q6PF15 583 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 DSELQ8IZU8 1212 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CARFQ8N187 725 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1L3Q8NH93 324 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRFN5Q96NI6 719 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM5Q9C035 493 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHST8Q9H2A9 424 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.21□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNA1CQ13936 2221 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIPSLA2A3N6 862 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC66A2RUB6 948 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL33A6NCF5 533 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEACAM4O75871 244 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTSBP07858 339 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGALP20701 1170 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACRV1P26436 265 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFS1P28331 727 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXN2P32314 431 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 UQCRFS1P47985 274 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PREPP48147 710 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMAN1P49257 510 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF75DP51815 510 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPT6Q14141 434 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 DBN1Q16643 649 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYVN1Q86TM6 617 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHC3Q8NDX5 983 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ULK4Q96C45 1275 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PANX2Q96RD6 677 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPS8Q99627 209 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR87Q9BY21 358 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM60AQ9NP50 221 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCND1Q9NSA2 647 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ICKQ9UPZ9 632 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.2□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MROH6A6NGR9 719 aa8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51F1A6NGY5 319 aa8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARGFXA6NJG6 315 aa8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEN1O00255 615 aa8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRTAMO95727 393 aa8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF224P0DH78 156 aa8.19□□□□□ -1.1
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPH1P17752 444 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms