RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 BAG5Q9UL15 447 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM221A6NGB7 291 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OR7A17O14581 309 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 WNT9AO14904 365 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DPM1O60762 260 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NIPSNAP2O75323 286 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OR4Q2P0C623 313 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 EBLN1P0CF75 366 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PRPS2P11908 318 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DGKAP23743 735 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PRPH2P23942 346 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GNPDA1P46926 289 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MTPNP58546 118 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ISL1P61371 349 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CSNK2BP67870 215 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TAF10Q12962 218 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ABRQ12979 859 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CCL14Q16627 93 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 IL31Q6EBC2 164 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SBSNQ6UWP8 590 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 XKR5Q6UX68 686 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SVOPQ8N4V2 548 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FAM162AQ96A26 154 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DPY30Q9C005 99 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 KCNH6Q9H252 994 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 RMND5AQ9H871 391 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CPA4Q9UI42 421 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PKP3Q9Y446 797 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 H3BNC9 293 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SLC1A7O00341 560 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GNGT2O14610 69 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ENPP3O14638 875 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FFAR2O15552 330 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SERPINB7O75635 380 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 F11P03951 625 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MAPK1P28482 360 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FAM189BP81408 668 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF33BQ06732 778 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CD47Q08722 323 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ABHD18Q0P651 414 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 KCNAB2Q13303 367 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GPR17Q13304 367 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GALNT18Q6P9A2 607 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SLC15A4Q8N697 577 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 IPPKQ9H8X2 491 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.54■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GVM2 712 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 H7C4K7 107 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PIRTP0C851 137 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CYBAP13498 195 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TCF3P15923 654 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DCTP40126 519 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PTPN5P54829 565 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 BFSP2Q13515 415 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SELPLGQ14242 412 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OXA1LQ15070 435 aa16.53■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms