RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425239.5

ATG4B-209, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-209ENST00000425239 MED25Q71SY5 747 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 NXPE1Q8N323 547 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 C19orf60Q96EN9 201 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 FICDQ9BVA6 458 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 FAM60AQ9NP50 221 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 SNX7Q9UNH6 387 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 CACNA1DQ01668 2161 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-209ENST00000425239 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 C2orf81A6NN90 581 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 MATN2O00339 956 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ZNF185O15231 689 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 LDB2O43679 373 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 SPOPO43791 374 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CBX6O95503 412 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PVRP15151 417 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CDH3P22223 829 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CD151P48509 253 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 NCF4Q15080 339 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 HPS6Q86YV9 775 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PHC3Q8NDX5 983 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 HM13Q8TCT9 377 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 LCN9Q8WX39 176 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 KRT35Q92764 455 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 TCTN2Q96GX1 697 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 APOL2Q9BQE5 337 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 MFRPQ9BY79 579 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 COG4Q9H9E3 785 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 LUZP4Q9P127 313 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CCDC66A2RUB6 948 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ZNF749O43361 778 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 DPM1O60762 260 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 APOC2P02655 101 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CTSBP07858 339 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PRSS56P0CW18 603 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PREPP48147 710 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 LMAN1P49257 510 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 GEMP55040 296 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ATP1A4Q13733 1029 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 GSE1Q14687 1217 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ZIC1Q15915 447 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ODF2Q5BJF6 829 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 SNX20Q7Z614 316 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 TFR2Q9UP52 801 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 A6NL46 340 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CCL22O00626 93 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 KRT86O43790 486 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 ANXA9O76027 345 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CLDN1O95832 211 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CBSLP0DN79 551 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PSMB4P28070 264 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CBSP35520 551 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 SOX8P57073 446 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 PRKAA1Q13131 559 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 INPP5DQ92835 1189 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 RANBP9Q96S59 729 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 GPR83Q9NYM4 423 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-209ENST00000425239 C5AR2Q9P296 337 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms