RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf66Q96MD2 445 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCG4Q9H172 646 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMDEC1O15204 470 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 AHCYL1O43865 530 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MGRN1O60291 552 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CCNFP41002 786 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FPGSQ05932 587 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SAGP10523 405 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MTPNP58546 118 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DCST1Q5T197 706 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK15Q96Q40 435 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SNPHO15079 494 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPGP40121 348 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF33AQ06730 810 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 AP3S1Q92572 193 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 KLK6Q92876 244 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MTMR11A4FU01 709 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS10O43665 173 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPN5P54829 565 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 OLIG2Q13516 323 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEAL1Q15170 157 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAPC1Q16533 368 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RTL4Q6ZR62 310 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP68Q76N32 757 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PYCR2Q96C36 320 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 WASF2Q9Y6W5 498 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN4O14493 209 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 LYNP07948 512 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PLA2G16P53816 162 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 LPIN1Q14693 890 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNA6Q15825 494 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM171BQ6P995 826 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NUS1Q96E22 293 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MIPEPQ99797 713 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ANGPTL1O95841 491 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR5P85299 388 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 TEAD4Q15561 434 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT77Q7Z794 578 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC38A4Q969I6 547 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DLX3O60479 287 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR22Q99680 433 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DUSP26Q9BV47 211 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NEK6Q9HC98 313 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 NFKB2Q00653 900 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PYDC2Q56P42 97 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HID1Q8IV36 788 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MTRRQ9UBK8 725 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP6O75581 1613 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ALAS2P22557 587 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 GPM6BQ13491 265 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 IL36AQ9UHA7 158 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DLG1Q12959 904 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HAS3O00219 553 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS20O76081 388 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH12P55289 794 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PDGFRLQ15198 375 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 BRAT1Q6PJG6 821 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SRMSQ9H3Y6 488 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PQY0 241 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMD11O00231 422 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 HAT1O14929 419 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINA1P01009 418 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEA11P43364 429 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 BEND5Q7L4P6 421 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MTX2O75431 263 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTN5O94779 1100 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 MYBPC1Q00872 1141 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms