RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 NRSN2Q9GZP1 204 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 LATS2Q9NRM7 1088 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CDYLQ9Y232 598 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 RPN2P04844 631 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TYRP1P17643 537 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PDX1P52945 283 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CAMK2BQ13554 666 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TTLL9Q3SXZ7 439 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PHF19Q5T6S3 580 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ZBTB2Q8N680 514 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PHC3Q8NDX5 983 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 KLHL42Q9P2K6 505 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 POLG2Q9UHN1 485 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 KDM1AO60341 852 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 VPS26AO75436 327 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 AHSGP02765 367 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SSTR1P30872 391 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 LIMK2P53671 638 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CUL1Q13616 776 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 UGT3A1Q6NUS8 523 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CYS1Q717R9 158 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SLITRK4Q8IW52 837 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 IFT20Q8IY31 132 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TBC1D21Q8IYX1 336 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 FAM136AQ96C01 138 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 C9orf72Q96LT7 481 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 FOPNLQ96NB1 174 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SEMA6CQ9H3T2 930 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TRABD2BA6NFA1 517 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SPAG6O75602 509 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 F7P08709 466 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CSF2RBP32927 897 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CAPZBP47756 277 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SLC26A11Q86WA9 606 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 VRK3Q8IV63 474 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 OR5K2Q8NHB8 316 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 LCN9Q8WX39 176 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 NXPE2Q96DL1 559 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ZDHHC12Q96GR4 267 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 FMO2Q99518 471 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CMKLR1Q99788 373 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC187A0A096LP49 1063 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ATP5DP30049 168 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CFHR1Q03591 330 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF549Q6P9A3 640 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TTC23LQ6PF05 361 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 UNC5DQ6UXZ4 953 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TXNDC16Q9P2K2 825 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PTPRBP23467 1997 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 GABRB3P28472 473 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CLCN7P51798 805 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ABRQ12979 859 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PRKG2Q13237 762 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 ARMC6Q6NXE6 501 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 OOSP2Q86WS3 158 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 OR5AR1Q8NGP9 310 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CFAP61Q8NHU2 1237 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC74BQ96LY2 380 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 HGH1Q9BTY7 390 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 RAB33BQ9H082 229 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 SRMSQ9H3Y6 488 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 TAS2R13Q9NYV9 303 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 OGFRQ9NZT2 677 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 PDP2Q9P2J9 529 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 AK5Q9Y6K8 562 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-204ENST00000400919 CEP295Q9C0D2 2601 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 RHOXF2BP0C7M4 288 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 THRAP10827 490 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 RTP5Q14D33 572 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 RAB11FIP2Q7L804 512 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 STRA8Q7Z7C7 330 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 LSMEM2Q8N112 164 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 OR4E2Q8NGC2 313 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 RSC1A1Q92681 617 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 INPP5DQ92835 1189 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-204ENST00000400919 GATA6Q92908 595 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms