RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 BORCS5Q969J3 196 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PPP1R14BQ96C90 147 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MYO19Q96H55 970 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LHX3Q9UBR4 397 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 KLQ9UEF7 1012 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LRFN2Q9ULH4 789 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OARD1Q9Y530 152 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 VWA8A3KMH1 1905 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CROCCQ5TZA2 2017 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ELOVL7A1L3X0 281 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TAPBPO15533 448 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ABCB7O75027 752 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ULK1O75385 1050 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CD160O95971 181 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ALPIP09923 528 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ELNP15502 786 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GNPDA1P46926 289 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TUFMP49411 452 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MAPK10P53779 464 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TMBIM6P55061 237 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 KIAA0040Q15053 153 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SGO1Q5FBB7 561 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TAS1R1Q7RTX1 841 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LIX1Q8N485 282 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAM86B1Q8N7N1 296 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TBC1D15Q8TC07 691 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NCLNQ969V3 563 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ULK4Q96C45 1275 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CASD1Q96PB1 797 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TBCDQ9BTW9 1192 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 BOCQ9BWV1 1114 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ASB8Q9H765 288 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MAGEE1Q9HCI5 957 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ELOVL2Q9NXB9 296 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 INVSQ9Y283 1065 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GREB1Q4ZG55 1949 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GBF1Q92538 1859 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CXCR6O00574 342 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SEC22BO75396 215 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PRAMEF12O95522 483 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 IL6P05231 212 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PGRP06401 933 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 10
PRAME-201ENST00000398741 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ITGALP20701 1170 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MATN1P21941 496 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.355e-17■■□□□ 14.2
PRAME-201ENST00000398741 GDF5P43026 501 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 HMGCS1Q01581 520 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 BNIP3Q12983 259 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TAF12Q16514 161 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SMU1Q2TAY7 513 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FKBP9P1Q75LS8 142 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SVOPLQ8N434 492 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SMYD1Q8NB12 490 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MAGED4Q96JG8 741 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CD244Q9BZW8 370 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ACTR8Q9H981 624 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SMURF2Q9HAU4 748 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CCL27Q9Y4X3 112 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ADAM12O43184 909 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FZD6O60353 706 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NOBOXO60393 691 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TBL1XO60907 577 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SCELO95171 688 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 IL7RP16871 459 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CD247P20963 164 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 IST1P53990 364 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 C21orf59P57076 290 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NFATC3Q12968 1075 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TUBA3CQ13748 450 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SPANXN4Q5MJ08 99 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SPESP1Q6UW49 350 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 XKR5Q6UX68 686 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF554Q86TJ5 538 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms