RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 PRKD3O94806 890 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 NPPAP01160 153 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 HPGDP15428 266 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT1A6P19224 532 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT1A1P22309 533 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT1A4P22310 534 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT1A3P35503 534 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT1A5P35504 534 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 COX10Q12887 443 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 GPAT3Q53EU6 434 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CHSY3Q70JA7 882 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 C17orf64Q86WR6 236 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 KLHL1Q9NR64 748 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CD84Q9UIB8 345 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC28A2O43868 658 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TMCC2O75069 709 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TEAD4Q15561 434 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ALFQ53S48 1182 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MED27Q6P2C8 311 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC34A3Q8N130 599 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 OR52J3Q8NH60 311 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 PEX13Q92968 403 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 STK25O00506 426 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 BLVRAP53004 296 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TAZQ16635 292 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ACDQ96AP0 544 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1B0GW55 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CSNK2BP67870 215 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MZT2AQ6P582 158 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 KBTBD6Q86V97 674 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 NAT16Q8N8M0 369 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 HPS1Q92902 700 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DUX4Q9UBX2 424 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 AIREO43918 545 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 G6PDP11413 515 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 DIO3P55073 304 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MAPK15Q8TD08 544 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 GULP1Q9UBP9 304 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SNPHO15079 494 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 OR6B1O95007 311 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 LAG3P18627 525 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CSKP41240 450 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 PTSQ03393 145 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 EMX2Q04743 252 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 COL26A1Q96A83 441 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 AP2M1Q96CW1 435 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SYT17Q9BSW7 474 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TSC22D2O75157 780 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CXCL14O95715 111 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 IFNW1P05000 195 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 CD1DP15813 335 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 PRPS1L1P21108 318 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 FADS2P1A8MWK0 482 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 S1PR4O95977 384 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 ALPIP09923 528 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRN2-201ENST00000389413 TGFBIQ15582 683 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms