RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDXKO00764 312 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GPC4O75487 556 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GOLGA6DP0CG33 693 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ODC1P11926 461 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP1A3P13637 1013 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP41Q3LFD5 358 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 LINC00242Q5T6M2 205 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 AGBL2Q5U5Z8 902 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 QSOX2Q6ZRP7 698 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTN2A1Q7KYR7 527 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 DPPA4Q7L190 304 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 CATSPERDQ86XM0 798 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM139Q8IV31 216 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 EMC1Q8N766 993 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCC1Q96CN9 775 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACOX2Q99424 681 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 STRA6Q9BX79 667 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 G6PC2Q9NQR9 355 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALKBH4Q9NXW9 302 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR6C2Q9NZP2 312 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 NEU3Q9UQ49 428 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 H0Y3Z8 333 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PMM2O15305 246 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC14L5O43304 696 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATF3P18847 181 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PMELP40967 661 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELK3P41970 407 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GABRB2P47870 512 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 NAA25Q14CX7 972 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 LCN10Q6JVE6 187 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GCSAMQ8N6F7 178 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR6Y1Q8NGX8 325 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM47Q9BQJ4 181 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF670Q9BS34 389 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR14J1Q9UGF5 321 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 FER1L5A0AVI2 2057 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 UTYO14607 1347 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 K7ENM7 598 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFSF11O14788 317 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 APBB3O95704 486 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 VTNP04004 478 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF44P15621 663 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PNLIPRP1P54315 467 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 B3GALT5-AS1P59052 145 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALNT2Q10471 571 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALEQ14376 348 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 C20orf194Q5TEA3 1177 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMUB2Q71RG4 321 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZER1Q7Z7L7 766 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 SYTL1Q8IYJ3 562 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2L5Q8NG80 312 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 DHX58Q96C10 678 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCGF6Q9BYE7 350 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 NOTCH1P46531 2555 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GTF3C1Q12789 2109 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1W2PRB8 838 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 LYPD3O95274 346 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEC24AO95486 1093 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGLV3-19P01714 112 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOXB5P09067 269 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD1EP15812 388 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD81P60033 236 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTF1Q14872 753 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 GFOD2Q3B7J2 385 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL26Q53HC5 615 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 TXNDC8Q6A555 127 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 PAMR1Q6UXH9 720 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 MKXQ8IYA7 352 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR1J2Q8NGS2 313 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELSPBP1Q96BH3 223 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 H2AFJQ9BTM1 129 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLEC4EQ9ULY5 219 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMCC2O75069 709 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 AVILO75366 819 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV4-1P06312 121 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 TNFAIP3P21580 790 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-187P-201ENST00000384139 CA4P22748 312 aa0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms