RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 ALS2CLQ60I27 953 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 BORAQ6PGQ7 559 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 NPNTQ6UXI9 565 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 UCK1Q9HA47 277 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 MRGBPQ9NV56 204 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1B0GVC2 190 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 APOL1O14791 398 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 AURKAO14965 403 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 MTX2O75431 263 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 STK17BO94768 372 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 BRAFP15056 766 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 MSX1P28360 303 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 STT3AP46977 705 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 GFERP55789 205 aa6.84□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 CDK18Q07002 472 aa6.84□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 DIO2Q92813 273 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf72Q96LT7 481 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 VPS35Q96QK1 796 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 CHP1Q99653 195 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.84□□□□□ -1.31
CTXN3-201ENST00000379445 KLC4Q9NSK0 619 aa6.84□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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CTXN3-201ENST00000379445 COL12A1Q99715 3063 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PNR3 127 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 CDC14CA4D256 554 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 KMOO15229 486 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 NKX2-8O15522 239 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 VEGFDO43915 354 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJA2O60884 412 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 MFAP3LO75121 409 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 NDST3O95803 873 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 SLC4A1P02730 911 aa6.84□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 TPM3P06753 285 aa6.84□□□□□ -1.32
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