RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJA1P17302 382 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNT5AP41221 380 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDX1P52945 283 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX16P57768 344 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIRPAP78324 504 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR17Q13304 367 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBB2AQ13885 445 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF13Q15543 124 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF10Q5QP82 559 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD6Q86V97 674 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 AFAP1Q8N556 730 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 POC5Q8NA72 575 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBB2BQ9BVA1 445 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIFC3Q9BVG8 833 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNDC11Q9BVV2 318 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPAGT1Q9H3H5 408 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF22Q9HCT0 170 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSER1Q9NX31 292 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSD3Q9NYI0 1048 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNG5Q9UF02 275 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D29Q9UFV1 150 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS28Q9UK41 221 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 DISP3Q9P2K9 1392 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087X002 238 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PN81 502 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 HYKKA2RU49 373 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEIOCA2RUB1 952 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR32B1ATL7 298 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO1B7G3V0H7 640 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6V0E1O15342 81 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF11O60813 436 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 AVILO75366 819 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGNO95427 931 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSH1P0DML2 217 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSH2P0DML3 217 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALOX12P18054 663 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSL1P33121 698 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXD13P35453 343 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNA7P36544 502 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRIP1P48552 1158 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CX3CL1P78423 397 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK3Q00526 305 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHAF1BQ13112 559 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM187Q14656 261 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR1D2Q14995 579 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 WTAPQ15007 396 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE1FQ5T754 118 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT79Q5XKE5 535 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCUQ8NE86 351 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF128Q8TEB7 428 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD17B8Q92506 261 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK1Q96PY6 1258 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDF4Q9BRK5 362 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 GHITMQ9H3K2 345 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D22BQ9NU19 505 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WW49 117 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEPACAM2A8MVW5 462 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF9O43307 516 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRCC3O43542 346 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED24O75448 989 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAT1P21673 171 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRA5P31644 462 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-552P-201ENST00000362869 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms