RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 DYTNA2CJ06 578 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PDPK1O15530 556 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ALPIP09923 528 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GPR151Q8TDV0 419 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OR51V1Q9H2C8 321 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NRP1O14786 923 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GKN1Q9NS71 199 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PTGER3P43115 390 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 DGKEP52429 567 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf22Q49AR2 442 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF879B4DU55 563 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 UGT1A9O60656 530 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 NSG1P42857 185 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OLR1P78380 273 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CRHR2Q13324 411 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 C7orf26Q96N11 449 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GPM6BQ13491 265 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ACP5P13686 325 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 RAB25P57735 213 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 TLR1Q15399 786 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CLDND1Q9NY35 253 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 IL7RP16871 459 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH4A1P30038 563 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ING3Q9NXR8 418 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 ABI3Q9P2A4 366 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 MTPNP58546 118 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 AMZ2Q86W34 360 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 STX12Q86Y82 276 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 SDC2P34741 201 aa22.02■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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PTPRM-201ENST00000332175 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-201ENST00000332175 CPED1A4D0V7 1026 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 AXIN1O15169 862 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 MTX2O75431 263 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 UBXN7O94888 489 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 CCKBRP32239 447 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 CLCN7P51798 805 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 LNX2Q8N448 690 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 FAM13CQ8NE31 585 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 HPS1Q92902 700 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 DIRAS2Q96HU8 199 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.02■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 ASLP04424 464 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-201ENST00000332175 UGT1A3P35503 534 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SEPHS1P49903 392 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 KHKP50053 298 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 BCAP31P51572 246 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 NFATC2Q13469 925 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.113e-7■■■■□ 23
PTPRM-201ENST00000332175 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 SATL1Q86VE3 508 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-201ENST00000332175 GIPC3Q8TF64 312 aa22.01■■□□□ 1.11
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