RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 GANCQ8TET4 914 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 GLMNQ92990 594 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 MCUR1Q96AQ8 359 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 HIC2Q96JB3 615 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 FBRSQ9HAH7 460 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 MRGBPQ9NV56 204 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 FBXL12Q9NXK8 326 aa18.77■□□□□ 0.6
UPP1-201ENST00000331803 MBTPS2O43462 519 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CD1EP15812 388 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GGT5P36269 586 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PREPP48147 710 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ABRQ12979 859 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GTF2H3Q13889 308 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 WSCD2Q2TBF2 565 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 DNASE1L2Q92874 299 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GULP1Q9UBP9 304 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 MEI4A8MW99 385 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 VEGFDO43915 354 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 DNTTP04053 509 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PCCBP05166 539 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GSTM1P09488 218 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 COL9A1P20849 921 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CPOXP36551 454 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 HNMTP50135 292 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CCNG1P51959 295 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GSTM4Q03013 218 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 DNAL1Q4LDG9 190 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 METTL6Q8TCB7 284 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 COX14Q96I36 57 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SLC6A17Q9H1V8 727 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ST14Q9Y5Y6 855 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.76■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 COL4A2P08572 1712 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 A8MUI8 341 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 VPS4BO75351 444 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 KATNA1O75449 491 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 EPB42P16452 691 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 AP1S2P56377 157 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TRAF3Q13114 568 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 AGERQ15109 404 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 IER5LQ5T953 404 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TTC23LQ6PF05 361 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 HEATR4Q86WZ0 1026 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 FAM13CQ8NE31 585 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 POLG2Q9UHN1 485 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GPR34Q9UPC5 381 aa18.75■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PPC1 479 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CAPN1P07384 714 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PDHA2P29803 388 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PGM1P36871 562 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SLC25A3Q00325 362 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SQLEQ14534 574 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SNX32Q86XE0 403 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 PARP9Q8IXQ6 854 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CFAP206Q8IYR0 622 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 OR14C36Q8NHC7 312 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CCT7Q99832 543 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 RTKNQ9BST9 563 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 SLC32A1Q9H598 525 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CUL3Q13618 768 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 HERC3Q15034 1050 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP24Q8N264 748 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 NTMT1Q9BV86 223 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 CD248Q9HCU0 757 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 GIMAP2Q9UG22 337 aa18.74■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa18.73■□□□□ 0.59
UPP1-201ENST00000331803 H3BM21 787 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms