RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FRS2Q8WU20 508 aa18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MED10Q9BTT4 135 aa18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CXCR6O00574 342 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ZW10O43264 779 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FTH1P02794 183 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 DDOSTP39656 456 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MAP3K7CLP57077 242 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SP3Q02447 781 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA1841Q6NSI8 718 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GDPD3Q7L5L3 318 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 KBTBD8Q8NFY9 601 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 OR2T11Q8NH01 316 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GRPEL2Q8TAA5 225 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PIK3R3Q92569 461 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FAM162AQ96A26 154 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC32Q9BV29 185 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 RNF38Q9H0F5 515 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SLA2Q9H6Q3 261 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 RNF112Q9ULX5 631 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 LCHNA4D1U4 455 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ASB14A6NK59 587 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ZBBXA8MT70 800 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 KCNE1P15382 129 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SEPHS1P49903 392 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC81Q6ZN84 652 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ARMCX6Q7L4S7 300 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 DPP9Q86TI2 863 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 UBQLNLQ8IYU4 475 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SETD6Q8TBK2 473 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GAD1Q99259 594 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PCTPQ9UKL6 214 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.86■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PDZK1P1A8MUH7 402 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SERPINF2P08697 491 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FMO3P31513 532 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MAGEA2P43356 314 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 HTR3AP46098 478 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CYP4F3Q08477 520 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 DGCR6Q14129 220 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 XKR4Q5GH76 650 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 BRMS1LQ5PSV4 323 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MANEALQ5VSG8 457 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PARP16Q8N5Y8 322 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF382Q96SR6 550 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1B0GTL3 188 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD28O15084 1053 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 AIREO43918 545 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GLP2RO95838 553 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SLC25A27O95847 323 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PRKCAP17252 672 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FSHRP23945 695 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CTGFP29279 349 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SMU1Q2TAY7 513 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 SMUG1Q53HV7 270 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ATAD3CQ5T2N8 411 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 MICU2Q8IYU8 434 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CHPFQ8IZ52 775 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 GJD2Q9UKL4 321 aa18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FAM220BPB1ANY3 271 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 FAM20BO75063 409 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 RECQL4O94761 1208 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PRIM2P49643 509 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CAP1Q01518 475 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA0040Q15053 153 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PON2Q15165 354 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 CARTPTQ16568 116 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 PROX2Q3B8N5 592 aa18.84■□□□□ 0.61
MVB12A-201ENST00000317040 ATG9BQ674R7 924 aa18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms