RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 INPP5DQ92835 1189 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASF1AQ9Y294 204 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 GP1BAP07359 652 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ALDH4A1P30038 563 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT33BQ14525 404 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC38A3Q99624 504 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.26■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PNLIPP16233 465 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 TAS2R39P59534 338 aa22.25■■□□□ 1.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PPM1JQ5JR12 505 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PAQR3Q6TCH7 311 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPR22Q99680 433 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NFS1Q9Y697 457 aa22.25■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CD9P21926 228 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ILKQ13418 452 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF460Q14592 562 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NR1D2Q14995 579 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 EMBQ6PCB8 327 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPRED1Q7Z699 444 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PAFAH2Q99487 392 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.24■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 B4GAT1O43505 415 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 INHBAP08476 426 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ITGA2BP08514 1039 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATP5DP30049 168 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPR3P46089 330 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRKG2Q13237 762 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 DHRS13Q6UX07 377 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CEP97Q8IW35 865 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 HGH1Q9BTY7 390 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 DKK1O94907 266 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TUBBP07437 444 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC12A2P55011 1212 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCL7P80098 99 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 POU4F1Q01851 419 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 BMPR2Q13873 1038 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 AMZ1Q400G9 498 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ABCG4Q9H172 646 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CBSLP0DN79 551 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NDUFS1P28331 727 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CBSP35520 551 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 HSD17B3P37058 310 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 MSH2P43246 934 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLDN6P56747 220 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLCL1Q15111 1095 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 MROH9Q5TGP6 573 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CAVIN3Q969G5 261 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 MVB12BQ9H7P6 319 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 UCK1Q9HA47 277 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.22■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A1W2PQM1 296 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 HMX2A2RU54 273 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 LILRA5A6NI73 299 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 OPA1O60313 960 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAPK9P45984 424 aa22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.21■■□□□ 1.15
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