RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 H3BNX3 289 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 K7EPI3 171 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 LINC01565O15544 149 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 IDO1P14902 403 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 HSPA7P48741 367 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 HNMTP50135 292 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 KIF19Q2TAC6 998 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 SFT2D3Q587I9 215 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 LPCAT4Q643R3 524 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ASB11Q8WXH4 323 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 DTD2Q96FN9 168 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 COQ10AQ96MF6 247 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ARL15Q9NXU5 204 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 BTRCQ9Y297 605 aa15.01□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 OR7A17O14581 309 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 AREL1O15033 823 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MTX2O75431 263 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 KATNA1O75449 491 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 STK16O75716 305 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 KAT7O95251 611 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PRR35P0CG20 571 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ADRB3P13945 408 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 CD1EP15812 388 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 EPB42P16452 691 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GGT5P36269 586 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GRIA2P42262 883 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 RPS6KA2Q15349 733 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 TRIP10Q15642 601 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 LRRC36Q1X8D7 754 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 XKR7Q5GH72 579 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ZFP1Q6P2D0 407 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GK5Q6ZS86 529 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF765Q7L2R6 523 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MIER2Q8N344 545 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ICA1LQ8NDH6 482 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ELMO1Q92556 727 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 RAB7BQ96AH8 199 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ARRDC3Q96B67 414 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GDF15Q99988 308 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 EPHX3Q9H6B9 360 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ST14Q9Y5Y6 855 aa15□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GFYI3L273 518 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MAP3K13O43283 966 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ATG13O75143 517 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MATN4O95460 622 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 EPHX1P07099 455 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 CAPN1P07384 714 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 LAMP2P13473 410 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 CYP2A7P20853 494 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GPX3P22352 226 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PEX2P28328 305 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 CREB5Q02930 508 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GRM2Q14416 872 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 NLRP8Q86W28 1048 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 HIPK4Q8NE63 616 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 CENPKQ9BS16 269 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 NTMT1Q9BV86 223 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 WDR41Q9HAD4 459 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PDE10AQ9Y233 779 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 REV3LO60673 3130 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 SGTAO43765 313 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 EBLN1P0CF75 366 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 IL12RB1P42701 662 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 MAPK9P45984 424 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 AQP4P55087 323 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 AP1S2P56377 157 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 ADAM15Q13444 863 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 GRB7Q14451 532 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PIGGQ5H8A4 983 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.99□□□□□ -0.01
SF3B4-201ENST00000271628 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms