RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 AGRPO00253 132 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN4O14493 209 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ITM2AO43736 263 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CSKP41240 450 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CYP4F8P98187 520 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HM13Q8TCT9 377 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC38A4Q969I6 547 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 C8orf48Q96LL4 319 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GINS4Q9BRT9 223 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CALML5Q9NZT1 146 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 BCKDKO14874 412 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 IMPDH1P20839 514 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF33AQ06730 810 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ESAMQ96AP7 390 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 H3BNX3 289 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PLK4O00444 970 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PGRMC2O15173 223 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RASGRP1O95267 797 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 EDN1P05305 212 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PRKCHP24723 683 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CCNFP41002 786 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PRR5P85299 388 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC18A2Q05940 514 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TMC8Q8IU68 726 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CBR4Q8N4T8 237 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 GKN1Q9NS71 199 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PSAT1Q9Y617 370 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SQORQ9Y6N5 450 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OR51F1A6NGY5 319 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MAGEB17A8MXT2 336 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MCIDASD6RGH6 385 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OR1F1O43749 312 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TYROBPO43914 113 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 NT5EP21589 574 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RHAGQ02094 409 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 BEND5Q7L4P6 421 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SLC9A6Q92581 669 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MIPEPQ99797 713 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OXSMQ9NWU1 459 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 POMPQ9Y244 141 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ARL5AQ9Y689 179 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 USP54Q70EL1 1684 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RGS10O43665 173 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HNMTP50135 292 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HERVK_113P63132 956 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ERVK-8P63133 956 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 DLG1Q12959 904 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 VITQ6UXI7 678 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 SCML2Q9UQR0 700 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1W2PRU2 124 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FFAR2O15552 330 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 CDH3P22223 829 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ACTR3P61158 418 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PERM1Q5SV97 790 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 DCST1Q5T197 706 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM198Q66K66 360 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 OR10A6Q8NH74 314 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF563Q8TA94 476 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 RASSF1Q9NS23 344 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ENPP3O14638 875 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 BEST1O76090 585 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ANGPTL1O95841 491 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF846Q147U1 533 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM171BQ6P995 826 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRS-201ENST00000262963 ABCG4Q9H172 646 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms