RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PTSQ03393 145 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 KRT33BQ14525 404 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF284Q2VY69 593 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TEX26Q8N6G2 289 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM159Q96B96 161 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ARSGQ96EG1 525 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SLC29A1Q99808 456 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 MED12Q93074 2177 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 H0Y858 1186 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 NME4O00746 187 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 KERAO60938 352 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 EPB42P16452 691 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 VCLP18206 1134 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CR2P20023 1033 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TNFRSF1BP20333 461 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GPR1P46091 355 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CHIT1Q13231 466 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GPM6BQ13491 265 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SFRP1Q8N474 314 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 KIAA1191Q96A73 305 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TPD52L3Q96J77 140 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 RTKNQ9BST9 563 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 DPY30Q9C005 99 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 AP4S1Q9Y587 144 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 RTTNQ86VV8 2226 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 FAM92AA1XBS5 289 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GLOD5A6NK44 160 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SYCE1LA8MT33 242 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 STK25O00506 426 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GMNNO75496 209 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SLC22A3O75751 556 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 FKBP9O95302 570 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GNAO1P09471 354 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ATP6V1C1P21283 382 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SOAT1P35610 550 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 RFX3P48380 749 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PBX4Q9BYU1 374 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 COMMD8Q9NX08 183 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PCTPQ9UKL6 214 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 INVSQ9Y283 1065 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.92□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 STK16O75716 305 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 IL12AP29459 219 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PPM1AP35813 382 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 OR4D2P58180 307 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CDKL1Q00532 357 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 LIPEQ05469 1076 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 PIGFQ07326 219 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 DHCR24Q15392 516 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CARD16Q5EG05 197 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CYS1Q717R9 158 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 SATL1Q86VE3 508 aa8.91□□□□□ -0.98
CKAP2-201ENST00000258607 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms