RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.75■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa21.75■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GNGT2O14610 69 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC16A6O15403 523 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKD3O94806 890 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 F11P03951 625 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RETP07949 1114 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A4P14672 509 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC6A4P31645 630 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 DCTP40126 519 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GP2P55259 537 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 OXCT1P55809 520 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PIGFQ07326 219 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 LAPTM5Q13571 262 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RUNDC3AQ59EK9 446 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD34AQ69YU3 496 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SPESP1Q6UW49 350 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOC2Q96KP1 924 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 IPPKQ9H8X2 491 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC159P0C7I6 412 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPKAPK3Q16644 382 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR149Q86SP6 731 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM162AQ96A26 154 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.74■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BNC9 293 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 IL1RNP18510 177 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNQ1P51787 676 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 HUNKP57058 714 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL38P63173 70 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM32Q13049 653 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 OXA1LQ15070 435 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 EID3Q8N140 333 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 VMP1Q96GC9 406 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 SPON2Q9BUD6 331 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 MROQ9BYG7 248 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 IQCF5A8MTL0 148 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 IL6P05231 212 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH4P55283 916 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 OCA2Q04671 838 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PTGR1Q14914 329 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PON2Q15165 354 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2A13Q16696 494 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PLPP6Q8IY26 295 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 MICU2Q8IYU8 434 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 STK40Q8N2I9 435 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPV1Q8NER1 839 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 CPQQ9Y646 472 aa21.73■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 FFAR2O15552 330 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RGS14O43566 566 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM23O75077 832 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFS2O75306 463 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 INMTO95050 263 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 RFX4Q33E94 735 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ASIC5Q9NY37 505 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSL4O60488 711 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 GLUD1P00367 558 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 ALPK1Q96QP1 1244 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 HMG20AQ9NP66 347 aa21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms