RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hddc2Q3SXD3 199 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep295nlQ497N6 533 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ei24Q61070 340 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf1cQ6PDZ2 836 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl5Q6PFE1 708 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtg1Q8R2R6 326 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr617Q8VGA1 318 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r16aQ923M0 524 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MvdQ99JF5 401 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tor1bQ9ER41 336 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nme4Q9WV84 186 aa12.46□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp11A9YVJ5 442 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx43D3Z6P9 646 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10479K7N6H4 105 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TyrP11344 533 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd19P25918 547 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r16P59529 299 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx1bP61264 288 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmo5P97872 533 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnrc1Q3TWH3 297 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi47Q61635 420 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp65Q91W94 390 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a7Q91WU2 540 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TmlheQ91ZE0 421 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc50Q9CQ61 259 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pbld2Q9CXN7 288 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isca2Q9DCB8 154 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grb14Q9JLM9 538 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actl7aQ9QY84 440 aa12.46□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YCD0 109 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp558E9Q1J0 407 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd151O35566 253 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01668 110 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyr61P18406 379 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdx1P52946 284 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pip5k1bP70181 539 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem184cQ3TPR7 525 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm853Q3UNZ2 425 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2rx3Q3UR32 397 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar7aQ5QD12 358 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map2k2Q63932 401 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx31Q6P8Y7 439 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Morc4Q8BMD7 928 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nox1Q8CIZ9 591 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hacd3Q8K2C9 362 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr273Q8VG87 317 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D3J9 298 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb3Q9WV72 525 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rev3lQ61493 3122 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1200A2ATJ4 336 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zar1lC3VD30 291 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam151bD3YUE4 279 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClockO08785 855 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CkmP07310 381 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GsnP13020 780 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifrd1P19182 449 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp560Q3URI6 754 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnpla1Q3V1D5 599 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creb3Q61817 404 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec7aQ6QLQ4 244 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr12Q6QNU9 906 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btnl1Q7TST0 509 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fndc11Q80WB0 326 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IfneQ80ZF2 192 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgif2Q8C0Y1 237 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ipo13Q8K0C1 963 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr846Q8VET8 312 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plpp3Q99JY8 312 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp773Q9CZ29 471 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shmt2Q9CZN7 504 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tomm70Q9CZW5 611 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acer3Q9D099 267 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb5r1Q9DB73 305 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs3Q9DC04 966 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc13a2Q9ES88 586 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpc4apQ9JLV2 797 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Insl5Q9WUG6 135 aa12.45□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam46dB1ATX6 390 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap36B1AUC7 590 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc4B2RY50 1037 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glyatl3E9Q5L8 290 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r10K7N621 847 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult2b1O35400 338 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcr3O88410 367 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GhrP16882 650 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptger4P32240 513 aa12.44□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpx3P46412 226 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.7 ms