RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636901.1

CACNB4-238, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,706 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-238	ENST00000636901	ARFIP1	P53367	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	UGT2B15	P54855	530 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	BID	P55957	195 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	KCNQ4	P56696	695 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	HSD17B7	P56937	341 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NCS1	P62166	190 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	C2orf80	Q0P641	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	HECTD3	Q5T447	861 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TRNP1	Q6NT89	227 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901		Q8N402	240 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	DTX3	Q8N9I9	347 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ANKS1A	Q92625	1134 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TBCB	Q99426	244 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SNTG2	Q9NY99	539 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NCKAP5	O14513	1909 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TCAP	O15273	167 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SEMA3D	O95025	777 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RCBTB2	O95199	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	VIP	P01282	170 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	OPN1SW	P03999	348 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	IFI30	P13284	250 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	AKR1B1	P15121	316 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PRPH2	P23942	346 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	GIF	P27352	417 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	GRK5	P34947	590 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MAPK12	P53778	367 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NPRL3	Q12980	569 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	GRIK3	Q13003	919 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	FXN	Q16595	210 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RNF220	Q5VTB9	566 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TRIB1	Q96RU8	372 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	BRD7	Q9NPI1	651 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	VPS28	Q9UK41	221 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901		A0A1W2PQJ5	194 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901		H7BYZ3	331 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NDUFAB1	O14561	156 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	EI24	O14681	340 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	CDK2AP2	O75956	126 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	GJB6	O95452	261 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	AK1	P00568	194 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	KIT	P10721	976 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MTHFD2	P13995	350 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NAT1	P18440	290 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ATP4A	P20648	1035 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ITGB8	P26012	769 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MPI	P34949	423 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NPBWR1	P48145	328 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PIK3CG	P48736	1102 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RAB5C	P51148	216 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ACTG1	P63261	375 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ARG2	P78540	354 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	POU4F1	Q01851	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PARP6	Q2NL67	630 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	MPPE1	Q53F39	396 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	GPR107	Q5VW38	600 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ZNF773	Q6PK81	442 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ARL9	Q6T311	187 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	RTL4	Q6ZR62	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CACNB4-238	ENST00000636901	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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