RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 POLBP06746 335 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFS1P28331 727 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 RBL1P28749 1068 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ADRA1AP35348 466 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MARCKSL1P49006 195 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 XIAPP98170 497 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 NADK2Q4G0N4 442 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 LCN10Q6JVE6 187 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 BBS12Q6ZW61 710 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 DAAM2Q86T65 1068 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 EFCAB3Q8N7B9 438 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CPT1BQ92523 772 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 TLR10Q9BXR5 811 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 C1GALT1Q9NS00 363 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 GNLYP22749 145 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PTGIRP43119 386 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ABRQ12979 859 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PRKAA1Q13131 559 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 KRT33BQ14525 404 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 DSELQ8IZU8 1212 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 HM13Q8TCT9 377 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 FANCEQ9HB96 536 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SEC16AO15027 2179 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MATN2O00339 956 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM4O75871 244 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 APOC2P02655 101 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CDH3P22223 829 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 RORAP35398 523 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PRLHRP49683 370 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 OLIG2Q13516 323 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CNGA4Q8IV77 575 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 APOL2Q9BQE5 337 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 NLNQ9BYT8 704 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SNX7Q9UNH6 387 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 UNC79Q9P2D8 2635 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 H7C0C1 242 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 LCA5LO95447 670 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MSL3P1P0C860 447 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 RALBP11234 206 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA1P43355 309 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ATP5OP48047 213 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF789Q5FWF6 425 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 LCN9Q8WX39 176 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 KRT35Q92764 455 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ULK4Q96C45 1275 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SRMSQ9H3Y6 488 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 TCFL5Q9UL49 500 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CRTAMO95727 393 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN1P07384 714 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 NXPE1Q8N323 547 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 OR13C4Q8NGS5 318 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 OR1L3Q8NH93 324 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC66A2RUB6 948 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM63AO94886 807 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 AGFG2O95081 481 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 PREPP48147 710 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 C4orf17Q53FE4 359 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FHL5Q5TD97 284 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FAM69BQ5VUD6 431 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 HEXDCQ8WVB3 486 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 COPS8Q99627 209 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRF-216ENST00000617451 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms