RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613107.1

U6.58-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.58-201ENST00000613107 CAPN11Q9UMQ6 739 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TNRQ92752 1358 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 A0A1B0GTH9 108 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 A0A1B0GUA9 196 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CBY3A6NI87 242 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 RRN3P2A6NIE6 340 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TSC22D2O75157 780 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 GPX5O75715 221 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 MT-ND1P03886 318 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TFAP2AP05549 437 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CYP3A4P08684 503 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 G6PDP11413 515 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 BTF3P20290 206 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PRKAR2BP31323 418 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 DDIT3P35638 169 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 MNAT1P51948 309 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 RAD23BP54727 409 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ZBED6P86452 979 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PRKCEQ02156 737 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ARID5AQ03989 594 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SLAQ13239 276 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SERTAD2Q14140 314 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ACAP2Q15057 778 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 DHCR24Q15392 516 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PRSS8Q16651 343 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CDKN3Q16667 212 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 LETM2Q2VYF4 491 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 USP41Q3LFD5 358 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ABCA11PQ4W5N1 156 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ESCO2Q56NI9 601 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 AADACL2Q6P093 401 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CTR9Q6PD62 1173 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 RNF144BQ7Z419 303 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 DNAAF5Q86Y56 855 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 DENND1CQ8IV53 801 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CEND1Q8N111 149 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PARP16Q8N5Y8 322 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SCAIQ8N9R8 606 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 AGBL3Q8NEM8 1001 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 KBTBD8Q8NFY9 601 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 THAP6Q8TBB0 222 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 FAF2Q96CS3 445 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 C18orf8Q96DM3 657 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 C16orf74Q96GX8 76 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 RIPOR3Q96MK2 946 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ZNF560Q96MR9 790 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 DEPDC7Q96QD5 511 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CDRT15Q96T59 188 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TTC1Q99614 292 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SLX1AQ9BQ83 275 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PAAF1Q9BRP4 392 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 KATNAL1Q9BW62 490 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 LRMDAQ9H2I8 198 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 NANOGQ9H9S0 305 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PCDH12Q9NPG4 1184 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 HPS4Q9NQG7 708 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PCM1Q15154 2024 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 LTBP1Q14766 1721 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 CACNA1AO00555 2505 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TRIM43BA6NCK2 446 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 OR6C76A6NM76 312 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ANKRD66B4E2M5 251 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PRSS46E5RG02 174 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 M0QYT0 321 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 BUD23O43709 281 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 IGSF3O75054 1194 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TMCC2O75069 709 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 ATP2C2O75185 946 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 MTA2O94776 668 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 STK10O94804 968 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 KRT14P02533 472 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 LIPFP07098 398 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 LYNX1P0DP58 116 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 TXNP10599 105 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.58-201ENST00000613107 PEPDP12955 493 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms