RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 RPA4Q13156 261 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 MDM1Q8TC05 714 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 GLMNQ92990 594 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SCYL1Q96KG9 808 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 DERL2Q9GZP9 239 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 CACNA1HO95180 2353 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SLCO2B1O94956 709 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PPP2R2AP63151 447 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 DMPKQ09013 629 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 TCEA2Q15560 299 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 FOPNLQ96NB1 174 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 CSF2P04141 144 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 CD1DP15813 335 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 IDSP22304 550 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 GLRBP48167 497 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 CTBSQ01459 385 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PTERQ96BW5 349 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 LOXL4Q96JB6 756 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 KLF15Q9UIH9 416 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 BTN3A1O00481 513 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 ZBTB14O43829 449 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 ACTR1BP42025 376 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 ACTR1AP61163 376 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.143e-7■■■■□ 22.6
ACTN4-210ENST00000588618 ACAP2Q15057 778 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 METRNLQ641Q3 311 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 CCDC63Q8NA47 563 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PLLPQ9Y342 182 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 TMEM131Q92545 1883 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SNX2O60749 519 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SLC34A2O95436 690 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SBK3P0C264 359 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PDHA2P29803 388 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 MAPK9P45984 424 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ACTN4-210ENST00000588618 PRR19A6NJB7 356 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 TM9SF1O15321 606 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ZWINTO95229 277 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 RBP1P09455 135 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 MPC1LP0DKB6 136 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 TFEBP19484 476 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ETV4P43268 484 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 KCNC1P48547 511 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ATP1A2P50993 1020 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 IRX4P78413 519 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ELOCQ15369 112 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 KIF19Q2TAC6 998 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 CCDC153Q494R4 210 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ISCA2Q86U28 154 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 SPASTQ9UBP0 616 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 TK2O00142 265 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 CDC7O00311 574 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 CLCNKAP51800 687 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 WDR4P57081 412 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 OR4D1Q15615 310 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 ALG9Q9H6U8 611 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-210ENST00000588618 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms