RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	GSTA2	P09210	222 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SPINK2	P20155	84 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CD1C	P29017	333 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ATP5D	P30049	168 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	HAL	P42357	657 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	MAGEA4	P43358	317 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CD151	P48509	253 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CLCN7	P51798	805 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	EPHA4	P54764	986 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	OR1D5	P58170	312 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SHC2	P98077	582 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	E2F1	Q01094	437 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CUL1	Q13616	776 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	GPR18	Q14330	331 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.58	□□□□□ -0.56	4e-7	■■■■□ 20.3
USP22-211	ENST00000584538	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	FMO2	Q99518	471 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538		F8W8V4	182 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PIAS1	O75925	651 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	MT-CO3	P00414	261 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	AHSG	P02765	367 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	MYBL2	P10244	700 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	BRD3	Q15059	726 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CYS1	Q717R9	158 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	NDN	Q99608	321 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	NRTN	Q99748	197 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PFDN6	O15212	129 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	VIP	P01282	170 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	APOA4	P06727	396 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	FDXR	P22570	491 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CAPZB	P47756	277 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CDKN2D	P55273	166 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	GPLD1	P80108	840 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	SPIDR	Q14159	915 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	GRB7	Q14451	532 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	TMED2	Q15363	201 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP22-211	ENST00000584538	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56

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