RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OOSP2Q86WS3 158 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GPR150Q8NGU9 434 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 HM13Q8TCT9 377 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 HDAC10Q969S8 669 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PMEPA1Q969W9 287 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C1Q96RD1 312 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ZPBPQ9BS86 351 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 APMAPQ9HDC9 416 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CASS4Q9NQ75 786 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C74A6NCV1 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 AP3B1O00203 1094 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 QSOX1O00391 747 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 EFSO43281 561 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN12O43309 604 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SGTAO43765 313 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 STK17BO94768 372 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 AP2A2O94973 939 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FTH1P02794 183 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR56A5P0C7T3 313 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFS1P28331 727 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SH3BP2P78314 561 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ITIH4Q14624 930 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PCID2Q5JVF3 399 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 DTX1Q86Y01 620 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BMPERQ8N8U9 685 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PHC3Q8NDX5 983 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR4L1Q8NH43 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 LCN9Q8WX39 176 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ELMO1Q92556 727 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 UBXN4Q92575 508 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NKD1Q969G9 470 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RNF31Q96EP0 1072 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A14Q96JA4 679 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PBKQ96KB5 322 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP9Q96S59 729 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 COG4Q9H9E3 785 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BFARQ9NZS9 450 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GSAPA4D1B5 854 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR5K3A6NET4 321 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K7O43318 606 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KIF5CO60282 957 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PRB1P04280 392 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GSTM1P09488 218 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB6P18564 788 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PDHA2P29803 388 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FOXN2P32314 431 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PREPP48147 710 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NPY2RP49146 381 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1CAP62136 330 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms