RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MUC2	Q02817	5179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772		E7EQ34	232 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772		H3BMH7	237 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	BCKDK	O14874	412 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CASK	O14936	926 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF749	O43361	778 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	LIAS	O43766	372 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MAN1A2	O60476	641 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	LCA5L	O95447	670 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CD46	P15529	392 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	BMP5	P22003	454 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CRYGS	P22914	178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PSMA5	P28066	241 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	GK	P32189	559 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MC3R	P41968	323 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CLCNKA	P51800	687 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	DSCR9	P59020	149 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2H	P62256	183 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	STK3	Q13188	491 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MESD	Q14696	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	DDB2	Q92466	427 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772		G3V4G9	280 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CDC7	O00311	574 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TEX33	O43247	280 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NME2P1	O60361	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ENDOD1	O94919	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	DEXI	O95424	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CD160	O95971	181 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ESR1	P03372	595 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CD48	P09326	243 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	COX6A1	P12074	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ACPP	P15309	386 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NME2	P22392	152 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ETFB	P38117	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PCYT1A	P49585	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	DLG4	P78352	724 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	IL13RA1	P78552	427 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ARF5	P84085	180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RALGDS	Q12967	914 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	OR1C1	Q15619	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RBBP7	Q16576	425 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	UGP2	Q16851	508 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772		Q6ZUG5	572 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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