RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.09□□□□□ -0.15
CMTM3-215ENST00000568477 HEATR9A2RTY3 570 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TLCD2A6NGC4 264 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 AP2A2O94973 939 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 GSTM1P09488 218 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PSMA3P25788 255 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ARL4DP49703 201 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 GNG11P61952 73 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 GSTM4Q03013 218 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SEMA5AQ13591 1074 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 MAP7Q14244 749 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ITIH4Q14624 930 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TBR1Q16650 682 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00303Q3SY05 128 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC38Q502W7 563 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF592Q92610 1267 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PAK5Q9P286 719 aa14.08□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 OR6C74A6NCV1 312 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FGF5P12034 268 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ETS1P14921 441 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 STAT5AP42229 794 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 NSG1P42857 185 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RPA4Q13156 261 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CCNG2Q16589 344 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF605Q86T29 641 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 KMT5CQ86Y97 462 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 EXD3Q8N9H8 876 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TRIM58Q8NG06 486 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RANBP9Q96S59 729 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 MAP3K3Q99759 626 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PDE7BQ9NP56 450 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.07□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 OR51F1A6NGY5 319 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 QSOX1O00391 747 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA0754O94854 1291 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 APRTP07741 180 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF28P17035 718 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ADRA1DP25100 572 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CASQ1P31415 396 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FOXN2P32314 431 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 GRIA1P42261 906 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CD151P48509 253 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ACY1Q03154 408 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PRKAA1Q13131 559 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TUBB3Q13509 450 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PACS1Q6VY07 963 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CARFQ8N187 725 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 LCN9Q8WX39 176 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RNF31Q96EP0 1072 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 TTC1Q99614 292 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 CASS4Q9NQ75 786 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RARRES3Q9UL19 164 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.06□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 MATN2O00339 956 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SPAG6O75602 509 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FGGP02679 453 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FTH1P02794 183 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FAM87AP0C7U9 286 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 EBLN1P0CF75 366 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 SFTPCP11686 197 aa14.05□□□□□ -0.16
CMTM3-215ENST00000568477 FOLR1P15328 257 aa14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms