RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CACNG1Q06432 222 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 SEMA3AQ14563 771 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 KCNJ11Q14654 390 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 BRD3Q15059 726 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PCID2Q5JVF3 399 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 XKR5Q6UX68 686 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PIM3Q86V86 326 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CREG2Q8IUH2 290 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 GPR150Q8NGU9 434 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CPT1BQ92523 772 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 ULK4Q96C45 1275 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 RNF31Q96EP0 1072 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 MFSD3Q96ES6 412 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 RANBP9Q96S59 729 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 NRTNQ99748 197 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 WWP1Q9H0M0 922 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 ZNF358Q9NW07 568 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.05□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 A0A0G2JNG1 304 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CTAGE9A4FU28 777 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 OR5K4A6NMS3 321 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 IQCF5A8MTL0 148 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 RALBP11234 206 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CCL4P13236 92 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 AMD1P17707 334 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 VCLP18206 1134 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 TPSB2P20231 275 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PSMA3P25788 255 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 ITPKBP27987 946 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PDHA2P29803 388 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 GPR3P46089 330 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PREPP48147 710 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 LSSP48449 732 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 NPY2RP49146 381 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 MAPK10P53779 464 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PRAMEP78395 509 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 KIR2DS5Q14953 304 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 NR1D2Q14995 579 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PPP1R7Q15435 360 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 TPSAB1Q15661 275 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 RPE65Q16518 533 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 GPR33Q49SQ1 333 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 BCL7AQ4VC05 210 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 METRNLQ641Q3 311 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 C4orf22Q6V702 233 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PHC3Q8NDX5 983 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 OR2L2Q8NH16 312 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 OR4L1Q8NH43 312 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 OR10G6Q8NH81 332 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 WDR48Q8TAF3 677 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 CRELD1Q96HD1 420 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 C12orf66Q96MD2 445 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 TMEM74Q96NL1 305 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 STRADBQ9C0K7 418 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 BFARQ9NZS9 450 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 OGFRQ9NZT2 677 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 PISDQ9UG56 409 aa8.04□□□□□ -1.12
LINS1-211ENST00000560941 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms