RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560834.1

CTDSPL2-210, Transcript of CTD small phosphatase like 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSPL2, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2-210ENST00000560834 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 YKT6O15498 198 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 AQP9O43315 295 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 VPS26AO75436 327 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GPC4O75487 556 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TRIM16O95361 564 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF883P0CG24 379 aa6.89□□□□□ -1.31
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CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 AOAHP28039 575 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GMPRP36959 345 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ACTR1BP42025 376 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 MSH2P43246 934 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLCO1A2P46721 670 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PREPP48147 710 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 RAB15P59190 212 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TAS2R39P59534 338 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ACTR1AP61163 376 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRR20EP86478 221 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRR20CP86479 221 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRR20DP86480 221 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRR20BP86481 221 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRR20AP86496 221 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF844Q08AG5 666 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.317e-6■□□□□ 9.5
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CTDSPL2-210ENST00000560834 CASP8Q14790 479 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 RASA2Q15283 850 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 AMZ2Q86W34 360 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 VRK3Q8IV63 474 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 LMX1AQ8TE12 382 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SAP25Q8TEE9 199 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ANKRD7Q92527 254 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ELMO1Q92556 727 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.89□□□□□ -1.31
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CTDSPL2-210ENST00000560834 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 KLC4Q9NSK0 619 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CTDSPL2-210ENST00000560834 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.89□□□□□ -1.31
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CTDSPL2-210ENST00000560834 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DHRS7Q9Y394 339 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.89□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 KLHL33A6NCF5 533 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SMIM23A6NLE4 172 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 B4DGG1 531 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 E5RI56 91 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 LMO7DNF2Z398 122 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 F8W8V4 182 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TPP1O14773 563 aa6.88□□□□□ -1.31
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CTDSPL2-210ENST00000560834 PCDHGA12O60330 932 aa6.88□□□□□ -1.31
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CTDSPL2-210ENST00000560834 KCNJ13O60928 360 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CDH16O75309 829 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TSPAN12O95859 305 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CTSEP14091 401 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 CNTFP26441 200 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 PDHA2P29803 388 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ATP5DP30049 168 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SERPINB8P50452 374 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SERPINB9P50453 376 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 POU4F1Q01851 419 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 TMED2Q15363 201 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 ELOCQ15369 112 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTDSPL2-210ENST00000560834 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.88□□□□□ -1.31
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