RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	NAT14	Q8WUY8	206 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PANX3	Q96QZ0	392 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ERP44	Q9BS26	406 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CARD6	Q9BX69	1037 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PRORY	Q9H606	182 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	COG4	Q9H9E3	785 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	WHRN	Q9P202	907 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549		H3BMM5	538 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KPNA5	O15131	536 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KLK10	O43240	276 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DUX1	O43812	170 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFS3	O75489	264 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PRSS56	P0CW18	603 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ITGA8	P53708	1063 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MAPK10	P53779	464 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ARL4C	P56559	192 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CAV1	Q03135	178 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CALCOCO2	Q13137	446 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RPE65	Q16518	533 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	HIF1A	Q16665	826 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LONRF1	Q17RB8	773 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NEPRO	Q6NW34	567 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MNS1	Q8NEH6	495 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CMKLR1	Q99788	373 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PDP2	Q9P2J9	529 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RAD51C	O43502	376 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ESR1	P03372	595 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MAPK9	P45984	424 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	C2orf54	Q08AI8	447 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SEMA3A	Q14563	771 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TGIF1	Q15583	401 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL35	Q6PF15	583 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NCSTN	Q92542	709 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	USP7	Q93009	1102 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DPH1	Q9BZG8	443 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RAB33B	Q9H082	229 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	P2RY12	Q9H244	342 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549		A8MU76	341 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	C9orf172	C9J069	976 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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