RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 PDZD3Q86UT5 571 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 KRT222Q8N1A0 295 aa9.13□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 A0A0G2JNG1 304 aa9.12□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 IQCF5A8MTL0 148 aa9.12□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 ZW10O43264 779 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 MATN4O95460 622 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 WNT1P04628 370 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CFIP05156 583 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 RETP07949 1114 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ZNF883P0CG24 379 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 TPBGLP0DKB5 382 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ACP5P13686 325 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CD1DP15813 335 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ITGB6P18564 788 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ACTR1BP42025 376 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 ACTR1AP61163 376 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 PPP2R2AP63151 447 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 CDKL1Q00532 357 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-220ENST00000550700 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 CSHL1Q14406 222 aa9.12□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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CS-220ENST00000550700 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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