RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-210	ENST00000549362	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SNX19	Q92543	992 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SI	P14410	1827 aa		4.36	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SCN4A	P35499	1836 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	BANF1	O75531	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	STAMBP	O95630	424 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	CALCA	P01258	141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ANXA6	P08133	673 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	THRA	P10827	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MCF2	P10911	925 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PGAM1	P18669	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	DNAJB1	P25685	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	MST1	P26927	711 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	NTSR1	P30989	418 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SLC5A2	P31639	672 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SERPINB6	P35237	376 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	GPD2	P43304	727 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ACADSB	P45954	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SLC1A6	P48664	564 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	GATM	P50440	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SERPINB8	P50452	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	RABGGTB	P53611	331 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SOX10	P56693	466 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	OCA2	Q04671	838 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	TUBB3	Q13509	450 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.35	□□□□□ -1.71
USP25-210	ENST00000549362	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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