RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 CTAGE9A4FU28 777 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NCN8 305 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TLCD2A6NGC4 264 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 AGAP14A8MT82 685 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf74A8MZ97 194 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LDB2O43679 373 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 METTL18O95568 372 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 TTC4O95801 387 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 HBQ1P09105 142 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TPH1P17752 444 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNFP41002 786 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC19A1P41440 591 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 FOXM1Q08050 763 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DET1Q7L5Y6 550 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf72Q96LT7 481 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKMY1Q9P2S6 941 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RARRES3Q9UL19 164 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1DQ01668 2161 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR5K3A6NET4 321 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 A8MU76 341 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 E5RI56 91 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 K7ENP7 123 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL41O60662 606 aa5.47□□□□□ -1.53
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