RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SDCBP2Q9H190 292 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 NOD2Q9HC29 1040 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SNED1Q8TER0 1413 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0G2JN53 185 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HCRTO43612 131 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FAM163BP0C2L3 166 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 EPHA3P29320 983 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CLCQ05315 142 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SLC1A5Q15758 541 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB6Q15916 424 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RORBQ92753 470 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 COQ7Q99807 217 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CLDN7O95471 211 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KIR3DL1P43629 444 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OMPP47874 163 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 JAM2P57087 298 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MORN1Q5T089 497 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD8Q6ZWB6 473 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MIPEPQ99797 713 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PDE7BQ9NP56 450 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ACSS2Q9NR19 701 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TAC3Q9UHF0 121 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LDB2O43679 373 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF217O75362 1048 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 IL33O95760 270 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PIGRP01833 764 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HKDC1Q2TB90 917 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MECRQ9BV79 373 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PITPNM1O00562 1244 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TGM5O43548 720 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 VEGFDO43915 354 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RFPL2O75678 378 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MYL9P24844 172 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 NRLP54845 237 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OXR1Q8N573 874 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 C4BP0C0L5 1744 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 J3KR12 359 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 DUX1O43812 170 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GPR32O75388 356 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 UROSP10746 265 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 BNIP2Q12982 314 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GPR33Q49SQ1 333 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 EIPR1Q53HC9 387 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 SETD6Q8TBK2 473 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF516Q92618 1163 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GMLQ99445 158 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 PNPOQ9NVS9 261 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 CKLFQ9UBR5 152 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0J9YYE9 177 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 GNB5O14775 395 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 MUSKO15146 869 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 ALOX5P09917 674 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 COL6A2P12110 1019 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 RUNX3Q13761 415 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-204ENST00000538708 NEDD8Q15843 81 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms