RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GABRA4	P48169	554 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CDC16	Q13042	620 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZIC1	Q15915	447 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.76	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557		C9J4A7	227 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PEX12	O00623	359 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PCDH17	O14917	1159 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SGTA	O43765	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL18	O94889	574 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MSL3P1	P0C860	447 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	VCL	P18206	1134 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ITGAX	P20702	1163 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CA4	P22748	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	KIR3DL1	P43629	444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557		Q0VFX4	171 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	XRCC4	Q13426	336 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CARF	Q8N187	725 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.75	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557		E7EQ34	232 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AGPS	O00116	658 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	BTN3A1	O00481	513 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ13	O60928	360 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	COX6B1	P14854	86 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FER	P16591	822 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AGXT	P21549	392 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	FOLR3	P41439	243 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PCSK7	Q16549	785 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PTER	Q96BW5	349 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ACAN	P16112	2415 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GTL3	188 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	SOCS6	O14544	535 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	POLB	P06746	335 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	MST1	P26927	711 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	TMPRSS15	P98073	1019 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BBS1-222	ENST00000533557	KRT81	Q14533	505 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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