RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRIT1Q9P2V4 623 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 CPNE7Q9UBL6 633 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 DHRS7Q9Y394 339 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 KNL1Q8NG31 2342 aa11□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC19A1P41440 591 aa10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC12A2P55011 1212 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 MAZP56270 477 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 HHEXQ03014 270 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 DNAJC3Q13217 504 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC29A2Q14542 456 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 XKR5Q6UX68 686 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 C12orf66Q96MD2 445 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC38A3Q99624 504 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR21Q99679 349 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB21Q9UL25 225 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.99□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM131Q92545 1883 aa10.98□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 PPM1DO15297 605 aa10.98□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 INHBAP08476 426 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 CBSLP0DN79 551 aa10.98□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 CDK4P11802 303 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 ACADLP28330 430 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 NDUFS1P28331 727 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 CBSP35520 551 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR3P46089 330 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDKN2DP55273 166 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 E2F1Q01094 437 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 POU4F1Q01851 419 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 ABRQ12979 859 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 ILKQ13418 452 aa10.98□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
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TRAPPC4-211ENST00000533012 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 LGSNQ5TDP6 509 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 GUSBP11Q6P575 273 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 PDZD3Q86UT5 571 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 IFI44Q8TCB0 444 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZFPM2Q8WW38 1151 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 TSPAN17Q96FV3 270 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 RMDN2Q96LZ7 410 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 FOPNLQ96NB1 174 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 RBBP8Q99708 897 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 ABCG4Q9H172 646 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 MVB12BQ9H7P6 319 aa10.98□□□□□ -0.65
TRAPPC4-211ENST00000533012 POT1Q9NUX5 634 aa10.98□□□□□ -0.65
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