RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TANK	Q92844	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	BICD1	Q96G01	975 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CSF3R	Q99062	836 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TCHH	Q07283	1943 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1W2PQF6	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SYCE3	A1L190	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CLGN	O14967	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PRDM1	O75626	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CALM1	P0DP23	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CALM2	P0DP24	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CALM3	P0DP25	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	BTD	P43251	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NOV	P48745	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	GALC	P54803	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RPS13-208	ENST00000531908	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf226	A1L170	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908		M0QZ24	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HS6ST1	O60243	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	NMT2	O60551	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PTP4A3	O75365	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KDM4B	O94953	1096 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DEXI	O95424	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	YEATS4	O95619	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PMS2P2	O95744	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CCKBR	P32239	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CDH8	P55286	799 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GABPA	Q06546	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GPR180	Q86V85	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms