RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-203ENST00000526386 MYO10Q9HD67 2058 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-203ENST00000526386 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-203ENST00000526386 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.96□□□□□ -1.29
UBASH3B-203ENST00000526386 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM202A6NGA9 273 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 OR7A17O14581 309 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 CHUKO15111 745 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SNX2O60749 519 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ATG13O75143 517 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 KRT16P08779 473 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR35P0CG20 571 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 UROSP10746 265 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TRIM23P36406 574 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 CPOXP36551 454 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 GPR1P46091 355 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC6A12P48065 614 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ATP4BP51164 291 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 FOXA1P55317 472 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 KCNJ2P63252 427 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PCDH1Q08174 1060 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TRAF3Q13114 568 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SP140Q13342 867 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PTK2BQ14289 1009 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 FGL2Q14314 439 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PON2Q15165 354 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 XKR7Q5GH72 579 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM198Q66K66 360 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PNCKQ6P2M8 343 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 RINLQ6ZS11 566 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ACAD11Q709F0 780 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ELMO1Q92556 727 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 FBXL8Q96CD0 374 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM122AQ96E09 287 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 MSANTD3Q96H12 275 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 HIC2Q96JB3 615 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 C3orf30Q96M34 536 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 CCT7Q99832 543 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 HGH1Q9BTY7 390 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 NTMT1Q9BV86 223 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 TEX101Q9BY14 249 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 C1orf21Q9H246 121 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 KLC4Q9NSK0 619 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 GPR34Q9UPC5 381 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 A0A1W2PP55 124 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PRR19A6NJB7 356 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 E9PBE3 544 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 K7EPI3 171 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 NEMP1O14524 444 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 INPP4BO15327 924 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 GSC2O15499 205 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 DCXO43602 365 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-203ENST00000526386 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms