RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 PER2O15055 1255 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 EPHB6O15197 1021 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 ALDH1L1O75891 902 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 FGF18O76093 207 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 ACTL6BO94805 426 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGKV4-1P06312 121 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM200BP0CF97 657 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 IRF1P10914 325 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 NR2C1P13056 603 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 TNNT1P13805 278 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 HSD3B1P14060 373 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDHA2P29803 388 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 AXLP30530 894 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 HSPA7P48741 367 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPOXP50336 477 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 RPS18P62269 152 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 FUT7Q11130 342 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 TAF13Q15543 124 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CORO6Q6QEF8 472 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 QSOX2Q6ZRP7 698 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 LINC01006Q8NI28 216 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 SMPDL3BQ92485 455 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 GCC1Q96CN9 775 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CLEC5AQ9NY25 188 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 Q9UF83 564 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 YIPF1Q9Y548 306 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMCC2O75069 709 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRDM1O75626 825 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 ODC1P11926 461 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANPEPP15144 967 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPX3P22352 226 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 WNT4P56705 351 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CD81P60033 236 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 AP2B1P63010 937 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 GALNT2Q10471 571 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 GALEQ14376 348 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPP2R5BQ15173 497 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 TAF11Q15544 211 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 WSCD2Q2TBF2 565 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM209BQ5JX69 171 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM182AQ5T1J6 154 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF691Q5VV52 312 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF554Q86TJ5 538 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 MKXQ8IYA7 352 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 KIRREL3Q8IZU9 778 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC5A8Q8N695 610 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 NSMAFQ92636 917 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYADMQ96S97 322 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 STRA6Q9BX79 667 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 EPHX3Q9H6B9 360 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 CLEC4EQ9ULY5 219 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-904P-201ENST00000516206 VWA3AA6NCI4 1184 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 PDXKO00764 312 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 PLA2G6O60733 806 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 STAM2O75886 525 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 GCNT3O95395 438 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 PIGNO95427 931 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 HEXAP06865 529 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 ACHEP22303 614 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 POU1F1P28069 291 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 SERPINF1P36955 418 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATP4BP51164 291 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 PNLIPRP1P54315 467 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 GUCY2DQ02846 1103 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAB6CQ53S08 254 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 KLC3Q6P597 504 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF130Q86XS8 419 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 PM20D2Q8IYS1 436 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 BRI3BPQ8WY22 251 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 TBCBQ99426 244 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 PIP5K1AQ99755 562 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 SEMA3CQ99985 751 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 HOXD1Q9GZZ0 328 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAB6CQ9H0N0 254 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-904P-201ENST00000516206 IKZF5Q9H5V7 419 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms