RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 NXNQ6DKJ4 435 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CES3Q6UWW8 571 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DHRS13Q6UX07 377 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 USP51Q70EK9 711 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GLRX5Q86SX6 157 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM74Q86UV6 250 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM73Q86UV7 250 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MFSD6LQ8IWD5 586 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CALML6Q8TD86 181 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ISOC1Q96CN7 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MSANTD3Q96H12 275 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 POM121Q96HA1 1249 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CPB2Q96IY4 423 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SCYL1Q96KG9 808 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 IL12RB2Q99665 862 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NPAS2Q99743 824 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SLC29A1Q99808 456 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CORO1BQ9BR76 489 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CAPN10Q9HC96 672 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GIN1Q9NXP7 522 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ADA2Q9NZK5 511 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ACTR3BQ9P1U1 418 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SEPT3Q9UH03 358 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 EBF1Q9UH73 591 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FLNCQ14315 2725 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 KCNK1O00180 336 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMIM20-202ENST00000514384 SUV39H1O43463 412 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GPC4O75487 556 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJB5O75953 348 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 RASAL1O95294 804 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CPNE6O95741 557 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 C1RP00736 705 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NPPAP01160 153 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FYNP06241 537 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CD1EP15812 388 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 IL10P22301 178 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GPX3P22352 226 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ADORA2BP29275 332 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 HOXA9P31269 272 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TAF6P49848 677 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMIM20-202ENST00000514384 NDST2P52849 883 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TMBIM6P55061 237 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DAOAP59103 153 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TAS2R39P59534 338 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ADIGQ0VDE8 80 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MERTKQ12866 999 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 IGFBP7Q16270 282 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 AGKQ53H12 422 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DCAF6Q58WW2 860 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MTX3Q5HYI7 312 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FUT10Q6P4F1 479 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NOTUMQ6P988 496 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CNSTQ6PJW8 725 aa7.11□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PAOXQ6QHF9 649 aa7.11□□□□□ -1.27
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