RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 LINGO4Q6UY18 593 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CHST9Q7L1S5 443 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MOCOSQ96EN8 888 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MYADMQ96S97 322 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM15Q9C019 465 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CACNA1FO60840 1977 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 A0A087WW49 117 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 A0A0J9YWU9 116 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 H7C423 109 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MBD4O95243 580 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ACP2P11117 423 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 DPEP1P16444 411 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP5-9P26371 169 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SCML4Q8N228 414 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 FAM81BQ96LP2 452 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PR77 199 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 TO15178 435 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 DCXO43602 365 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CRLF1O75462 422 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PIGNO95427 931 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 RAF1P04049 648 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ACADMP11310 421 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 TYMPP19971 482 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 KCNC3Q14003 757 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 P2RY6Q15077 328 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CORO6Q6QEF8 472 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 METTL7BQ6UX53 244 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF383Q8NA42 475 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PRAC1Q96KF2 57 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ABHD6Q9BV23 337 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CDK19Q9BWU1 502 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PRB8 838 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 DNM1LO00429 736 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ATP6V0E1O15342 81 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CREB3O43889 395 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 RB1P06400 928 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 TPOP07202 933 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 CLTBP09497 229 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PRLRP16471 622 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 TM4SF1P30408 202 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MAPK4P31152 587 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PLA2G7Q13093 441 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MELKQ14680 651 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 DLG2Q15700 870 aa4.55□□□□□ -1.68
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PDE4D-221ENST00000514231 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 LYG1Q8N1E2 194 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF614Q8N883 585 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 MTERF3Q96E29 417 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PAK5Q9P286 719 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PN81 502 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 E9PI62 339 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-221ENST00000514231 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
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