RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842		H3BM21	787 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	MPC1L	P0DKB6	136 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CD1D	P15813	335 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ACAP2	Q15057	778 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CEP76	Q8TAP6	659 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	LOXL4	Q96JB6	756 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SCYL1	Q96KG9	808 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	KCNK6	Q9Y257	313 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842		A0A1B0GVT2	93 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM120B	A0PK00	339 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SCAMP1	O15126	338 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TM9SF1	O15321	606 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ZWINT	O95229	277 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CSF2	P04141	144 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CTSE	P14091	401 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	JUND	P17535	347 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	NR1D1	P20393	614 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PI4KA	P42356	2102 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CLCNKA	P51800	687 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SLC18A1	P54219	525 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PPP2R2A	P63151	447 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	27.93	■■■□□ 2.06	8e-9	■□□□□ 10.9
TTC19-208	ENST00000497842	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	VRK3	Q8IV63	474 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	GPR78	Q96P69	363 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF358	Q9NW07	568 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PLLP	Q9Y342	182 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842		R4GN57	208 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC189	A1A4V9	331 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	RBP1	P09455	135 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TFEB	P19484	476 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	IDS	P22304	550 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	MAPK9	P45984	424 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	GLRB	P48167	497 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CTBS	Q01459	385 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC153	Q494R4	210 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	KLF15	Q9UIH9	416 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF292	O60281	2723 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	BTN3A1	O00481	513 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB14	O43829	449 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PDHA2	P29803	388 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1191	Q96A73	305 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	FOPNL	Q96NB1	174 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PRR19	A6NJB7	356 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CTSK	P43235	329 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	LPAL2	Q16609	132 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	C16orf46	Q6P387	395 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	XKR5	Q6UX68	686 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM131	Q92545	1883 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CFI	P05156	583 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	C8G	P07360	202 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ABR	Q12979	859 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	KIF19	Q2TAC6	998 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ISCA2	Q86U28	154 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PDZD3	Q86UT5	571 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		27.89	■■■□□ 2.06

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